現(xiàn)在養(yǎng)殖行業(yè)中有益微生物的運(yùn)用，主要來講起源于日本微生物學(xué)家比嘉照夫發(fā)明的em。em中主要所含菌種有：

1、光合菌群（好氣性和嫌氣性）。如光合細(xì)菌和藍(lán)藻類。具有光合作用和固氮作用。屬于獨(dú)立營(yíng)養(yǎng)微生物 ，能自我增殖。菌體本身含60%以上的蛋白質(zhì) ，且富含多種維生素，還含有輔酶Q10、抗病毒物質(zhì)和促生長(zhǎng)因子；它以土壤接受的光和熱為能源，將土壤中的硫氫和碳?xì)浠衔镏械臍浞蛛x出來，變有害物質(zhì)為無(wú)害物質(zhì)，并以植物根部的分泌物、土壤中的有機(jī)物、有害氣體（硫化氫等）及二氧化碳、氮等為基質(zhì)，合成糖類、氨基酸類、維生素類、氮素化合物、抗病毒物質(zhì)和生理活性物質(zhì)等，是肥沃土壤和促進(jìn)動(dòng)植物生長(zhǎng)的重要力量。

光合菌群的代謝物質(zhì)可以被植物直接吸收，還可以成為其它微生物繁殖的養(yǎng)分。光合細(xì)菌如果增殖，其它的有益微生物也會(huì)增殖。例如，VA菌根菌以光合菌分泌的氨基酸為食餌 ，它既能溶解不溶性磷，又能與固氮菌共生，使其固氮能力成倍提高。

2、乳酸菌群（嫌氣性）。以嗜酸乳桿菌為主導(dǎo)。它靠攝取光合細(xì)菌、酵母菌產(chǎn)生的糖類形成乳酸。乳酸具有很強(qiáng)的殺菌能力，能有效抑制有害微生物的活動(dòng)和有機(jī)物的急劇腐敗分解。乳酸菌能夠分解在常態(tài)下不易分解的木質(zhì)素和纖維素，并消除未分解有機(jī)物產(chǎn)生的種種弊端;合成各種氨基酸，維生素、產(chǎn)生消化酶、促進(jìn)新陳代謝，還有融化不溶性無(wú)機(jī)磷的能力。

乳酸菌還能夠抑制連作障礙產(chǎn)生的致病菌增殖。致病菌活躍，有害線蟲會(huì)急劇增加，植物就會(huì)衰弱，乳酸菌抑制了致病菌，有害線蟲便會(huì)逐漸消失。

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