在我國農業部允許使用的微生物菌種目錄中，常用的活性微生物主要是乳酸菌、糞鏈球菌、芽胞桿菌、酵母菌等，這些菌類雖各有特點和不同作用效果，但其促生長機理在本質上是一致的。有益微生物進入動物機體后，形成優勢菌群，與有害菌爭奪氧、附著位點和營養素，競爭性的抑制有害菌的生長，從而調節腸道內菌群趨于正常化；微生物代謝產生有機酸，降低動物腸道pH值，殺滅潛在的病源菌；產生代謝物抑制腸內胺和氨的產生；產生各種消化酶，有利于養分分解；合成B族維生素、氨基酸、未知促生長因子等營養物質；直接刺激腸道免疫細胞而增加局部免疫抗體，增強機體抗病力。正常的微生物菌群的生理功能是動物生存必需的一個生理系統，是除骨骼、肌肉、神經、附屬(皮、毛、指或趾甲)、淋巴(免疫)、呼吸、消化、內分泌、心血管、泌尿、雄性和雌性生殖系統(Morieb,1995)之外的第十三個生理系統，參與了動物體的生長、發育、消化、吸收、營養、免疫、生物拮抗及其各種功能和結構的發生、發展和衰退的全過程，發揮著一系列重要的作用：

①胃腸菌群促進胃腸黏膜細胞的發育和成熟(解剖修飾作用)；

②腸粘膜的菌群屏障作用；

③口服耐受性和激活免疫系統，促進免疫細胞成熟，包括B細胞、T細胞、M細胞及吞噬細胞、體液免疫、細胞免疫、產溶菌酶細胞等；

④產生多種消化酶，促進營養消化、吸收和代謝，包括對蛋白質或氮素、脂類、碳水化合物、維生素、無機鹽和黏液代謝等；

⑤胃腸菌群產生遷移傳動復合物(migrating motor　complexes,MMC),刺激腸蠕動；

⑥代謝產酸，酸化腸道環境，活化酶系統和抑制偏堿性有害微生物的生長。動物的微生態系統就是通過上述多種作用，最終產生抑制有害菌群，增強免疫功能，防治疾病，提高飼料營養素的消化吸收和轉化效率，促進動物產品(肉、蛋、奶、毛、皮等)的形成和品質改善。

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